Действие разворачивается в 0097 году Вселенского века, спустя три года после падения осиротевшей колонии и окончания Второй Нео-Зионской войны. Человечество пытается зализать раны, но призраки прошлого не желают уходить в тень. На поверхность всплывает секретный проект «Феникс», породивший легенду о призрачном Гандаме — «Нарративе». Этот мобильный доспех, лишённый души и пилота, обладает невероятной силой и неуправляемым психо-полем, способным искажать реальность. За ним охотятся три силы: земная федерация, желающая поставить точку в истории психо-фрейма; остатки Нео-Зиона, мечтающие использовать его мощь для возрождения идеалов; и таинственная организация, готовая на всё ради контроля над артефактом.
В центре событий — трое друзей детства, чьи пути разошлись после войны. Джона Башта, пилот-испытатель Федерации, получает задание пилотировать экспериментальный протез «Нарратива» — урезанную версию легендарного «Феникса». Его задача — перехватить настоящий артефакт раньше, чем это сделают враги. Но на его пути встаёт Мишель Луо, девушка, ставшая пилотом Нео-Зиона и одержимая идеей найти «Феникс», чтобы исполнить волю погибшего командира. Третьим становится Ритти Марден, их общий друг, который теперь служит аналитиком в тайной организации, манипулирующей событиями из тени. Их личные драмы, невысказанные обиды и общая травма войны переплетаются с погоней за призраком. Каждый из них видит в «Фениксе» не просто оружие, а шанс искупить вину, вернуть утраченное или обрести покой. Финал раскрывает истинную природу «Нарратива» — он не машина для убийства, а кристаллизованная боль и надежда человечества, и только от выбора трёх бывших друзей зависит, станет ли эта сила проклятием или спасением для нового поколения.