Спокойствие в Академии-сити нарушено. Акселератор, сильнейший эспер, получивший пулю в голову и лишившийся возможности полноценно использовать свои способности, вынужден влачить жалкое существование в больничной палате. Его дни проходят в скуке и раздражении, пока однажды на пороге не появляется девочка по имени Эстер Розенталь. Она утверждает, что является ведьмой, и просит защиты от таинственной организации, которая охотится за ней. Акселератору нет дела до её проблем, но внезапно на них нападает отряд вооруженных солдат, использующих странные технологии. В ходе стычки выясняется, что Эстер способна управлять ангельскими и демоническими сущностями, а её преследователи — члены культа, стремящиеся заполучить её силу для проведения опасного ритуала. Акселератору приходится вступить в бой, чтобы защитить себя и случайную спутницу, но его ослабленное состояние и повреждённый мозг делают каждое использование способностей смертельным риском.
Пока Акселератор пытается разобраться в происходящем, он сталкивается с новым врагом — загадочной девушкой по имени Лилина, которая обладает способностью манипулировать тёмной материей и, кажется, знает о нём больше, чем кто-либо. Культ не отступает, и в ход идут всё более изощрённые методы, включая создание искусственных ангелов и манипуляции с реальностью. Эстер, несмотря на свою внешнюю хрупкость, оказывается ключом к древнему пророчеству, способному уничтожить или спасти мир. Акселератор, привыкший действовать в одиночку и презирающий слабость, постепенно начинает видеть в девочке не просто обузу, а человека, заслуживающего защиты. Ему приходится не только сражаться с могущественными противниками, но и преодолевать собственные ограничения, чтобы вновь обрести контроль над своей силой. В финальной схватке, когда ставки достигают предела, Акселератор демонстрирует, что даже с повреждённым разумом он остаётся самым опасным человеком в Академии-сити, способным переписать законы физики ради спасения тех, кто ему дорог.