Обычный школьный день в Оде, пригороде Токио, оборачивается кошмаром, когда небо раскалывает ослепительная вспышка, а земля уходит из-под ног. Семеро детей — Таити, Сора, Иззи, Матт, Мими, Джо и Такари — оказываются втянутыми в цифровой водоворот, который переносит их на залитые солнцем луга Цифрового мира. Но это не та радужная страна чудес, которую они могли бы ожидать. Мир искажен: данные рассыпаются в пыль, а по земле бродят искаженные тени дигимонов, лишенные воли и разума. Дети приземляются поодиночке, и каждый сталкивается с первым испытанием — встречей со своим партнером-дигимоном, который появляется из сгустка искаженных данных. Агумон, Габумон, Пьемон, Палмон, Гомамон, Тентамон и даже крошечный Токомон — все они напуганы и дезориентированы не меньше своих избранных. Первые минуты — это хаос: паника, слезы и отчаянные попытки понять, что произошло. Таити находит Агумона, который едва может стоять на ногах, и понимает, что их связь — единственный якорь в этом безумии. Вместе они делают первый шаг в неизвестность, не зная, что их ждет впереди.
Собравшись в группу, дети обнаруживают, что Цифровой мир умирает. Древо жизни, источник всей цифровой энергии, гниет изнутри, пораженное вирусом, который порождает хаос. За этим стоит не просто злодей, а древняя сущность — Миллениумон, чье сознание было раздроблено на фрагменты и заточено в разных уголках мира. Каждый фрагмент — это отдельная катастрофа: один превращает океан в кислоту, другой замораживает целые континенты, третий стирает воспоминания дигимонов. Детям приходится учиться сражаться на ходу, их дигимоны эволюционируют не от силы, а от отчаяния и желания защитить друг друга. Первая эволюция Греймона происходит, когда Таити бросается под удар, чтобы спасти Сору — это не триумф, а крик души. Пролог заканчивается тем, что группа находит первое святилище, где они должны восстановить баланс, но цена оказывается высокой: Джо жертвует собой, чтобы закрыть разлом, и его дигимон исчезает вместе с ним, оставляя остальных в слезах и шоке. Они понимают, что это не игра и не приключение — это война за выживание двух миров, и обратного пути нет.