Вторая часть Фури-кури начинается ровно с того момента, где закончилась первая: Харуко Харухара, наконец-то вытащив Наоту Никадо из головы гигантского робота, пытается осознать, что её жизнь снова вошла в привычное русло. Но спокойствие длится недолго. В город Мосидэ возвращается старшая сестра Харуко — Мамими, которая неожиданно бросает свою музыкальную карьеру в США. Она привозит с собой странный чемодан, внутри которого, как выясняется, находится загадочный прибор, способный управлять гравитацией. Мамими утверждает, что нашла способ навсегда избавить мир от «медицинских машин» — гигантских роботов, которые периодически вылезают из головы Наоты. Однако её метод оказывается слишком радикальным: она планирует переписать саму структуру реальности, стерев все воспоминания о странностях, произошедших в городе. Харуко и Наота, который теперь носит на лбу повязку, скрывающую робота-медика, оказываются перед выбором: позволить сестре создать идеальный, но пустой мир или сохранить свою странную, нелепую, но настоящую жизнь, полную хаоса и чувств.
Параллельно с этим разворачивается личная драма. Мамими, всегда казавшаяся Харуко идеалом, на самом деле страдает от одиночества и страха перед будущим. Она завидует младшей сестре, которая, несмотря на все безумие, нашла в себе смелость любить и быть любимой. В попытке «исправить» Харуко, Мамими использует гравитационный прибор, чтобы заставить её забыть Наоту. Но сила чувств Харуко оказывается сильнее физики: она буквально пробивает пространство, чтобы вернуться к нему. Кульминацией становится финальная битва, где Наота, наконец, учится контролировать свою «болезнь» — вместо того чтобы подавлять робота, он принимает его как часть себя. Вместе с Харуко, которая больше не боится быть уязвимой, они создают новый тип энергии — не разрушительной, а созидательной. Мамими, увидев их искренность, отказывается от своего плана. В финале трио — Харуко, Наота и Мамими — запускают в небо гигантский фейерверк из гитарных аккордов, который разрывает ткань реальности, но не уничтожает её, а делает чуточку более живой и абсурдной. Город Мосидэ остаётся прежним, но теперь все его жители подсознательно чувствуют: чудеса возможны, если не бояться быть смешными и искренними.
