Второй сезон «Космического линкора Тирамису» подхватывает Субару Итиносэ ровно в тот момент, когда он окончательно сроднился со своим мехом — легендарным «Дюрандалем». Казалось бы, пилот обрёл дзен: он может чистить зубы, не покидая кабины, и даже умудряется заваривать лапшу быстрого приготовления прямо в кокпите, используя тепло от реактора. Но космос не терпит статики. На Земле и в колониях зреет новый заговор, связанный с таинственной организацией, которая хочет заполучить технологии «Тирамису» любой ценой. Субару, погружённый в рутину боевых вылетов и бесконечных бытовых проблем внутри своего робота, даже не замечает, как становится главной мишенью. Враги подбираются всё ближе, используя не только лазеры и ракеты, но и психологические атаки, пытаясь выбить пилота из его привычного равновесия. Однако главная угроза исходит не от внешних сил, а от собственного экипажа: старший брат Субару, Иссуга, продолжает свои безумные попытки навязать младшему братскую любовь через тотальный контроль и абсурдные приказы, а механики линкора, кажется, специально создают условия, в которых Субару вынужден проводить в кабине ещё больше времени.
Параллельно с этим разворачивается череда совершенно нелепых ситуаций, которые ставят под угрозу не только миссии, но и психику самого пилота. Субару пытается найти идеальный угол обзора для зеркала заднего вида, чтобы видеть свои волосы во время боя, ведёт философские диспуты с системой искусственного интеллекта своего меха о смысле существования и однажды застревает в аварийном люке, пытаясь достать упавшую банку энергетика. Враги, тем временем, оказываются не менее странными: один из антагонистов одержим идеей победить Субару в танцевальном баттле, другой — использует гигантского робота в форме тостера. В финале сезона выясняется, что все эти нападения были лишь прикрытием для масштабного взлома нейросети «Тирамису», и Субару приходится вступить в финальную схватку, не вылезая из кабины уже третьи сутки подряд. Он победит, конечно, но главным его триумфом станет не уничтожение вражеского флагмана, а то, что он наконец-то придумает, как закрепить подстаканник так, чтобы чай не проливался при резких манёврах.
