Пятый сезон «Гинтамы» начинается с того, что Кабуки-тё снова погружается в привычный хаос, но на этот раз тревожные нотки звучат громче обычного. Ёродзуя берётся за, казалось бы, рядовые заказы: найти пропавшего кота, который оказывается засланным казачком из космоса, или разобраться с новым видом ампана, вызывающим у людей неконтролируемую икоту во время серьёзных разговоров. Однако за этой абсурдной ширмой всё отчётливее проступает тень Тэндошу. Синсэнгуми получает приказ свыше, который ставит их на грань предательства собственных принципов, а старые враги, вроде Бэнзай Сакуры, внезапно предлагают временный союз против куда более страшной угрозы. Гинтоки, который обычно решает всё ударом деревянного меча и шуткой про дзёни, впервые задумывается: что, если на этот раз смех не сработает? Сезон балансирует между гротескными пародиями на «Звёздные войны» и «Блич», где персонажи переодеваются в костюмы джедаев и синигами, и моментами леденящей тишины, когда Кагура впервые серьёзно говорит о том, что её клан Йато может быть призван на войну.
Вторая половина сезона резко сбрасывает маски. Арка «Король-призрак» заставляет Сакату Гинтоки вспомнить, что его прошлое — это не только уроки Сёё-сэнсэя, но и кровь, которую он пролил на поле боя. Когда на пороге Ёродзуи появляется маленькая девочка, утверждающая, что она — реинкарнация древнего военачальника, жаждущего уничтожить Эдо, Гинтоки понимает: Тэндошу использует детей как оружие. Параллельно Хидзиката вступает в смертельную дуэль с новым капитаном Синсэнгуми, который носит маску, скрывающую лицо, и владеет техникой меча, способной разрезать время. Самым тяжёлым испытанием становится арка «Серебряная душа», где выясняется, что все предыдущие битвы были лишь прелюдией к вторжению Альтаны — инопланетной сущности, питающейся страхом. Гинтоки, теряя близких одного за другим, вынужден сделать невозможный выбор: либо уничтожить источник силы Эдо, пожертвовав всеми, кто дорог, либо позволить миру превратиться в безликую массу. Финал сезона — это не просто драка, а танец на лезвии ножа между отчаянием и надеждой, где даже самый трусливый персонаж, вроде Хасегавы, находит в себе смелость бросить вызов небесам. Последняя сцена оставляет зрителя с вопросом: можно ли сохранить улыбку, когда мир рушится на части?