Второй сезон «Компании «Маги-Люмьер» начинается с того, что Райто и его команда наконец-то получают официальную лицензию на оказание магических услуг. Казалось бы, вот он — путь к стабильности и признанию. Но с ростом популярности приходят и новые проблемы. В городе появляется конкурирующая корпорация «Кристальная Сфера», которая использует агрессивный маркетинг и сомнительные технологии, чтобы переманить клиентов. Их методы вызывают сбои в магической экосистеме: заклинания начинают давать непредсказуемые последствия, а обычные люди всё чаще становятся жертвами бытовых чар, вышедших из-под контроля. Райто и его друзья пытаются разобраться в происходящем, но натыкаются на стену корпоративной тайны. Параллельно выясняется, что у Каори, тихой сотрудницы отдела кадров, есть тёмное прошлое, связанное с основателями «Кристальной Сферы». Ей приходится сделать сложный выбор между верностью старой команде и долгом перед семьёй, которая когда-то её предала.
В то же время в коллективе «Маги-Люмьер» назревает внутренний кризис. Такуми, гениальный артефактор, начинает сомневаться в этичности своей работы, когда одно из его изобретений случайно стирает память пожилой женщине. Он уходит в запой и едва не разрушает лабораторию. Юки, вечно весёлая ведьма, берёт на себя слишком много заказов и впервые сталкивается с профессиональным выгоранием — её магия начинает давать сбои в самый неподходящий момент. Райто, пытаясь удержать команду от распада, заключает опасную сделку с таинственным коллекционером редких гримуаров. Тот обещает предоставить информацию о слабых местах «Кристальной Сферы» в обмен на артефакт, который хранится в подвале офиса. В финале сезона команда устраивает дерзкую операцию по спасению магического квартала от энергетического коллапса, устроенного конкурентами. Но цена победы оказывается высокой: один из членов команды жертвует своей магией навсегда, а Райто понимает, что настоящая магия — это не сила, а умение доверять тем, кто рядом, даже когда весь мир против вас.